در نظام جمهوری اسلامی ایران که بر پایه‌ی نظریه‌ی ولایت فقیه ساماندهی یافته، این سئوال مطرح است که نسبت میان نظریه‌ی ولایت فقیه و نظریه‌ی تفکیک قوا چیست؟ و با توجه به این که هردو نظریه در قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران پذیرفته شده، آیا بین آن‌ها سازگاری وجود دارد؟ با فرض وجود این سئوال و اختلاف دیدگاه‌ها در نظریه‌ی ولایت فقیه، هدف عمده‌ی پژوهش حاضر، پاسخ‌گویی به پرسش از ماهیت و جایگاه تفکیک قوا در نظریه‌ی ولایت فقیه است. بر این اساس در فصل‌های متعدد این پژوهش بر این نکته تاکید شده که تنها در صورتی می‌توان از نسبت میان ولایت فقیه و نظریه‌ی تفکیک قوا گفت و گو کرد که مفهوم متخذ از ولایت فقیه به معنای تعطیلی عقول نخبگان و سلب انتخاب‌گری از مردم، به ویژه دخالت در کار قوا و نهادها نباشد. عناوین مختلف کتاب، بدین‌قرار است: “ولایت مطلقه‌ی فقیه: دیدگاه وتفسیرها”، “تفکیک قوا: مفهوم، مبانی و بسترها”، “منزلت تفکیک قوا در نظریه‌ی ولایت فقیه” و “مناسبات ولی فقیه با قوا و نهادهای حکومتی”.