در جلد دوم از «دفتر خاطرات یک نینجای کلاس ششمی»، «چیس کوپر»، یک پسر لاغر مُردنی است که نینجای شماره یک مدرسه «بیوکنن» می باشد؛ به زودی قرار است شورشی بزرگ در مدرسه اتفاق بیفتد، شورشی که دزدان دریایی و نینجاها را در مقابل هم قرار می دهد و…